asyan.org
добавить свой файл
1
Пропозиції стосовно проекту

Створення біомаркерного профілю для пацієнтів з церебральним паралічем

Гіпотези


  1. ДНК послідовності, рівні протеїнів та пептидів можуть мати діагностичне значення в пацієнтів у порівнянні зі здоровими людьми

  2. Після проведення терапії, рівні протеїнових та пептидних біомаркерів в пацієнтів можуть змінюватися в сторону нормалізації

  3. Біомаркерний профіль може визначати ступінь важкості пацієнтів з ДЦП чи прогнозувати успішність та результати лікування

  4. Біомаркерний профіль пацієнтів, які добре реагують на лікування, відрізняється від пацієнтів, резистивний до лікування

Специфічні цілі


  1. Описати та оцінити рівні біомаркерів у пацієнтів та здорових дітей

  2. Провести довготривалу оцінку біомаркерів у пацієнтів в процесі проведення лікування

  3. Проаналізувати кореляцію ДНК маркерів з результатами лікування

  4. Провести новітні дослідження застосовуючи сучасні новітні протеомічні підходи до ідентифікації нових біомаркерів



А. Створення біомаркерного профілю


Метою цього дослідження є виділення набору достовірних біомаркерів , характерних для ДЦП та провести кореляцію цих даних з пацієнтами поділеними на ендофенотипи після лікування. Можливі декілька результатів. В найкращому випадку, ми будемо спостерігати що у групі пацієнтів, які добре реагують на лікування рівні біомаркерів будуть змінюватися в сторону нормальних значень. Проте є можливим, що не всі біомаркери будуть змінюватися після лікування, і такі біомаркери можуть називатися «фіксованими» завдяки генетичному дефекту, такому як зміна послідовності ДНК. Безсумнівно, буде також дуще цікаво ідентифікувати та вивчити біомаркери у пацієнтів, які резистивні до лікування.

Загальний опис приведено нижче.

  • Проаналізувати медичну документацію пацієнтів

  • Зібрати характеристики пацієнтів, історію хвороби, медикаменти

  • Діагноз та інформована згода

  • Кожен пацієнт буде мати свій номер і наклейку зі штрих кодом

  • Взяти мазокзі щоки, першу ранішню сечу (до їжі та пиття) та аналіз крові (з пальця)

  • Сеча збирається в 50 мл поліпропіленову пробірку

  • Біоматеріали заморожуються при мінус 20 С

  • Проводиться курс лікування

  • В останній день береться мазок зі щоки, перша ранкова сеча та кров

  • Біоматеріали заморожуються при мінус 20 С

  • Всі матеріали аналізуються в Бергені

    • сеча розморожується, фільтрується, центрифугується і тестується на рН

    • сеча аналізується на вміст креатиніну

    • нормалізована до 250 наномолів креатиніну сеча аналізується метьододм зворотньої хроматографії

    • результати порівнюються з даними здорових дітей (які видають нормальними психіатру)

    • піки та молекули ідентифікуються та оцінюються

    • компютерна програма буде створена для знаходження профілів

    • профілі будуть порівнюватися для кожного ендофенотипу

    • профілі будуть давати діагностичу інформацію

    • профілі будутиь давати прогностичну інформацію

    • профілі будуть давати «тераностичну» інформацію (яке лікування застосовувати

    • зміни стану пацієнта будуть порівнюватися зі змінами біомаркерів

    • Пацієнти будуть поділені на групи (ендофенотипи) згідно діагнозу та прогнозу

    • Мазок зі щоки буде проаналізований, ДНК буде виділене, квантоване, та заморожене

    • Вибрані гени будуть аналізуватися стосовно запропонованих гіпотез

    • Кров буде зберігатися замороженою доти доки не виникне потреба у ній

  • Біоматеріал буде повернено в для подальшого зберігання в Трускавці

  • Весь процес повториться при наступному курсі лікування пацієнта


Потім будуть генеруватися біомаркерні профілі, піки будуть ідентифікуватися шляхом масс спектроскопії застосовуючи методи MALDI-TOF та SLEDI-TOF. Інформація буде скомпільована на окремому комп’ютері, який оцінить які молекули у профілі відповідають за захворювання, а також дасть змогу спрогнозувати результати лікування.

Етапи проведення


Деякі етапі очікується провести ще в цьому році. Модна буде описати біомаркерний профіль, ідентифікувати декілька біомаркерів і визначити чи лікування впливає на рівень цих біомаркерів. В додаток біомаркерні профілі окремих пацієнтів будуть сконструйовані та почнеться робота над генетичним профілем.

На основі цього знання буде змога розробюляти потужні інструменти які допоможуть прогнозувати ефективність лікування та вибрати необхідний спосіб лікування.

В подалшому, ці знання можуть застосовуватися для : 1) покращення допомоги пацієнтам, 2) розробити новітні методи лікувння, 3) розробити нові медикаменти.

Очікується, що деякі суттєві результати, отримані в результаті досліджень, будуть опубліковані у високо рейтингових міжнародних наукових журналах.